Ačkoliv je velmi důležité uchovat své klíče v bezpečí, může to být poněku unavné, když máte klíčů hodně.
Kdykoliv vytvoříte nový veřejný šifrovací klíč, nevytvoří se jeden klíč, ale pár klíčů. Tento pár klíčů tvoří hlavní klíč a podklíč. Hlavní klíč může být použit k vytvoření dodatečných podklíčů, které s ním budou spojeny.
Hlavní klíč se používá k podepisování ostatních klíčů, k vytváření podklíčů a k odvolávání podklíčů. Hlavní klíč musí být udržován opravdu v bezpečí. V hlavním klíči se sdružují také podpisy důvěry. V případě, že je hlavní klíč kompromitován, nemáte jinou možnost, než jej odvolat a s ním i všechny připojené podklíče.
Výchozí podklíč se používá k šifrování a dešifrování zpráv. Dodatečné podklíče mohou být použity k vytváření podpisů. Ačkoliv je důležité, aby vaše podklíče zůstaly v bezpečí, můžete podklíč, kdykoliv je kompromitován, odvolat a vytvořit místo něj nový s původním hlavním klíčem.