Shotwell enregistre habituellement sa base de données et les miniatures de photos dans le répertoire ~/.shotwell. Ce répertoire ne contient pas de photos, mais la base de données dans ce répertoire contient une liste de toutes les photos de la photothèque Shotwell.

En tant que fonctionnalité avancée, il est possible d’avoir de multiples photothèques Shotwell, chacune avec son propre lot de photos. Chaque photothèque doit disposer de son propre répertoire de base de données. Pour lancer Shotwell avec une autre photothèque, définissez un autre répertoire de base de données dans la ligne de commande de la manière suivante :