Para iniciar um novo jogo, pressione o botão de menu no canto superior direito da janela e selecione Novo jogo. Se você já estiver jogando, o Hitori perguntará se você deseja parar o jogo atual.

Para pintar uma célula, clique nela; para desfazer a pintura, clique nela novamente. Quando as células são pintadas de tal forma que nenhuma das três regras sejam quebradas, o jogo terminará e o tabuleiro não poderá mais ser manipulado.

O Hitori também permite marcar células para sua própria referência ao resolver um tabuleiro. Isso pode ser feito pressionando Ctrl ou Shift e clicando em uma célula. Ambos marcam as células de maneira diferente e as células podem ser marcadas de ambas as maneiras ao mesmo tempo. Células marcadas podem ser desmarcadas clicando nelas novamente, enquanto mantém pressionadas as teclas Ctrl ou Shift novamente.

Para desfazer e refazer um movimento, escolha Desfazer ou Refazer na barra de cabeçalho. Você pode desfazer e refazer quantos movimentos você quiser sem restrição.

Para obter uma dica sobre quais células pintar, escolha Dica na barra de cabeçalho. Uma célula será sugerida com um contorno vermelho intermitente. Isso mostra que o status atual da célula (pintado ou não) está incorreto e deve ser alterado para que o jogo seja vencido.